摘要:細(xì)胞培養(yǎng)和機(jī)器學(xué)習(xí)上的紫外線“指紋”可以在30分鐘內(nèi)提供明確的是/否污染評估。
新加坡 - 麻省理工學(xué)院科研與技術(shù)聯(lián)盟(SMART,麻省理工學(xué)院在新加坡的研究機(jī)構(gòu))下屬的個性化醫(yī)療制造關(guān)鍵分析(CAMP)跨學(xué)科研究小組的研究人員,與麻省理工學(xué)院、新加坡科技研究局(A*STAR)皮膚研究實驗室以及新加坡國立大學(xué)合作,開發(fā)出了一種新方法,能夠在細(xì)胞治療產(chǎn)品(CTP)的生產(chǎn)過程早期,快速且自動地檢測和監(jiān)測微生物污染情況。通過測量細(xì)胞培養(yǎng)液的紫外線吸光度,并利用機(jī)器學(xué)習(xí)識別與微生物污染相關(guān)的光吸收模式,這種初步檢測方法旨在縮短無菌檢測的整體時間,進(jìn)而減少患者等待細(xì)胞治療產(chǎn)品劑量的時間。這一點尤為關(guān)鍵,因為對于絕癥患者而言,及時接受治療可能會挽救他們的生命。

細(xì)胞治療代表了醫(yī)學(xué)領(lǐng)域一個充滿前景的新前沿,尤其是在治療癌癥、炎癥性疾病和慢性退行性疾病等方面,它通過操縱或替換細(xì)胞來恢復(fù)功能或?qū)辜膊 H欢?xì)胞治療產(chǎn)品生產(chǎn)過程中的一個主要挑戰(zhàn)是,在將細(xì)胞給予患者之前,要快速有效地確保細(xì)胞沒有受到污染。
現(xiàn)有的基于微生物學(xué)方法的無菌檢測方法勞動強度大,檢測污染情況可能需要長達(dá) 14 天的時間,這可能會對急需治療的重癥患者產(chǎn)生不利影響。雖然像快速微生物檢測方法(RMMs)這樣的先進(jìn)技術(shù)可以將檢測周期縮短至 7 天,但它們?nèi)匀恍枰獜?fù)雜的流程,如細(xì)胞提取和生長富集培養(yǎng)基,而且在樣品提取、測量和分析等操作過程中高度依賴技術(shù)熟練的工人。這就迫切需要新的方法,既能在不影響細(xì)胞治療產(chǎn)品質(zhì)量的前提下更快得出檢測結(jié)果,滿足患者的使用時間要求,又能采用簡單的工作流程,無需額外的準(zhǔn)備工作。
在發(fā)表于《科學(xué)報告》雜志上的一篇題為《機(jī)器學(xué)習(xí)輔助的紫外吸收光譜法檢測細(xì)胞治療產(chǎn)品中的微生物污染》的論文中,SMART CAMP 的研究人員介紹了他們?nèi)绾谓Y(jié)合紫外吸收光譜法,開發(fā)出一種機(jī)器學(xué)習(xí)輔助的方法,用于在生產(chǎn)早期對細(xì)胞污染進(jìn)行無標(biāo)記、非侵入性的實時檢測。
這種方法相較于傳統(tǒng)的無菌檢測方法和快速微生物檢測方法具有顯著優(yōu)勢,因為它無需對細(xì)胞進(jìn)行染色以識別標(biāo)記的生物體,避免了細(xì)胞提取的侵入性過程,并且能在半小時內(nèi)得出檢測結(jié)果。它提供了一種直觀、快速的 “是 / 否” 污染評估,通過簡單的工作流程便于實現(xiàn)細(xì)胞培養(yǎng)采樣的自動化。此外,所開發(fā)的這種方法不需要專門的設(shè)備,從而降低了成本。

圖2平均吸光光譜
“這種快速、無標(biāo)記的方法被設(shè)計為細(xì)胞治療產(chǎn)品生產(chǎn)過程中的一個初步步驟,作為一種持續(xù)安全檢測的形式,它使用戶能夠盡早檢測到污染,并及時采取糾正措施,包括僅在檢測到可能的污染時才使用快速微生物檢測方法。這種方法節(jié)省了成本,優(yōu)化了資源配置,并最終加快了整個生產(chǎn)進(jìn)程。” SMART CAMP 的高級研究工程師、該論文的第一作者什魯?shù)?潘迪?切爾瓦姆(Shruthi Pandi Chelvam)說道。
“傳統(tǒng)上,細(xì)胞治療產(chǎn)品的生產(chǎn)勞動強度大,且受操作人員差異的影響。通過引入自動化和機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù),我們希望簡化細(xì)胞治療產(chǎn)品的生產(chǎn)流程,并降低污染風(fēng)險。具體來說,我們的方法支持在指定的時間間隔自動進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng)采樣以檢查污染情況,這減少了諸如樣品提取、測量和分析等手動操作任務(wù)。這使得能夠持續(xù)監(jiān)測細(xì)胞培養(yǎng)情況,并在早期階段檢測到污染。” 麻省理工學(xué)院電氣工程與計算機(jī)科學(xué)系的克拉倫斯?J?勒貝爾教授(Clarence J. LeBel)、SMART CAMP 的首席研究員、該論文的通訊作者拉杰夫?拉姆(Rajeev Ram)說道。
展望未來,后續(xù)的研究將集中于擴(kuò)大該方法的應(yīng)用范圍,以涵蓋更廣泛的微生物污染物,特別是那些代表當(dāng)前良好生產(chǎn)規(guī)范環(huán)境以及先前已確定的細(xì)胞治療產(chǎn)品污染物的微生物。此外,除了間充質(zhì)干細(xì)胞(MSCs)之外,還可以在更多的細(xì)胞類型上測試該模型的穩(wěn)健性。除了細(xì)胞治療產(chǎn)品的生產(chǎn)領(lǐng)域,這種方法還可以應(yīng)用于食品和飲料行業(yè),作為微生物質(zhì)量控制檢測的一部分,以確保食品產(chǎn)品符合安全標(biāo)準(zhǔn)。
參考資料
[1]Machine learning aided UV absorbance spectroscopy for microbial contamination in cell therapy products
摘要:細(xì)胞培養(yǎng)和機(jī)器學(xué)習(xí)上的紫外線“指紋”可以在30分鐘內(nèi)提供明確的是/否污染評估。
新加坡 - 麻省理工學(xué)院科研與技術(shù)聯(lián)盟(SMART,麻省理工學(xué)院在新加坡的研究機(jī)構(gòu))下屬的個性化醫(yī)療制造關(guān)鍵分析(CAMP)跨學(xué)科研究小組的研究人員,與麻省理工學(xué)院、新加坡科技研究局(A*STAR)皮膚研究實驗室以及新加坡國立大學(xué)合作,開發(fā)出了一種新方法,能夠在細(xì)胞治療產(chǎn)品(CTP)的生產(chǎn)過程早期,快速且自動地檢測和監(jiān)測微生物污染情況。通過測量細(xì)胞培養(yǎng)液的紫外線吸光度,并利用機(jī)器學(xué)習(xí)識別與微生物污染相關(guān)的光吸收模式,這種初步檢測方法旨在縮短無菌檢測的整體時間,進(jìn)而減少患者等待細(xì)胞治療產(chǎn)品劑量的時間。這一點尤為關(guān)鍵,因為對于絕癥患者而言,及時接受治療可能會挽救他們的生命。

細(xì)胞治療代表了醫(yī)學(xué)領(lǐng)域一個充滿前景的新前沿,尤其是在治療癌癥、炎癥性疾病和慢性退行性疾病等方面,它通過操縱或替換細(xì)胞來恢復(fù)功能或?qū)辜膊 H欢?xì)胞治療產(chǎn)品生產(chǎn)過程中的一個主要挑戰(zhàn)是,在將細(xì)胞給予患者之前,要快速有效地確保細(xì)胞沒有受到污染。
現(xiàn)有的基于微生物學(xué)方法的無菌檢測方法勞動強度大,檢測污染情況可能需要長達(dá) 14 天的時間,這可能會對急需治療的重癥患者產(chǎn)生不利影響。雖然像快速微生物檢測方法(RMMs)這樣的先進(jìn)技術(shù)可以將檢測周期縮短至 7 天,但它們?nèi)匀恍枰獜?fù)雜的流程,如細(xì)胞提取和生長富集培養(yǎng)基,而且在樣品提取、測量和分析等操作過程中高度依賴技術(shù)熟練的工人。這就迫切需要新的方法,既能在不影響細(xì)胞治療產(chǎn)品質(zhì)量的前提下更快得出檢測結(jié)果,滿足患者的使用時間要求,又能采用簡單的工作流程,無需額外的準(zhǔn)備工作。
在發(fā)表于《科學(xué)報告》雜志上的一篇題為《機(jī)器學(xué)習(xí)輔助的紫外吸收光譜法檢測細(xì)胞治療產(chǎn)品中的微生物污染》的論文中,SMART CAMP 的研究人員介紹了他們?nèi)绾谓Y(jié)合紫外吸收光譜法,開發(fā)出一種機(jī)器學(xué)習(xí)輔助的方法,用于在生產(chǎn)早期對細(xì)胞污染進(jìn)行無標(biāo)記、非侵入性的實時檢測。
這種方法相較于傳統(tǒng)的無菌檢測方法和快速微生物檢測方法具有顯著優(yōu)勢,因為它無需對細(xì)胞進(jìn)行染色以識別標(biāo)記的生物體,避免了細(xì)胞提取的侵入性過程,并且能在半小時內(nèi)得出檢測結(jié)果。它提供了一種直觀、快速的 “是 / 否” 污染評估,通過簡單的工作流程便于實現(xiàn)細(xì)胞培養(yǎng)采樣的自動化。此外,所開發(fā)的這種方法不需要專門的設(shè)備,從而降低了成本。

圖2平均吸光光譜
“這種快速、無標(biāo)記的方法被設(shè)計為細(xì)胞治療產(chǎn)品生產(chǎn)過程中的一個初步步驟,作為一種持續(xù)安全檢測的形式,它使用戶能夠盡早檢測到污染,并及時采取糾正措施,包括僅在檢測到可能的污染時才使用快速微生物檢測方法。這種方法節(jié)省了成本,優(yōu)化了資源配置,并最終加快了整個生產(chǎn)進(jìn)程。” SMART CAMP 的高級研究工程師、該論文的第一作者什魯?shù)?潘迪?切爾瓦姆(Shruthi Pandi Chelvam)說道。
“傳統(tǒng)上,細(xì)胞治療產(chǎn)品的生產(chǎn)勞動強度大,且受操作人員差異的影響。通過引入自動化和機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù),我們希望簡化細(xì)胞治療產(chǎn)品的生產(chǎn)流程,并降低污染風(fēng)險。具體來說,我們的方法支持在指定的時間間隔自動進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng)采樣以檢查污染情況,這減少了諸如樣品提取、測量和分析等手動操作任務(wù)。這使得能夠持續(xù)監(jiān)測細(xì)胞培養(yǎng)情況,并在早期階段檢測到污染。” 麻省理工學(xué)院電氣工程與計算機(jī)科學(xué)系的克拉倫斯?J?勒貝爾教授(Clarence J. LeBel)、SMART CAMP 的首席研究員、該論文的通訊作者拉杰夫?拉姆(Rajeev Ram)說道。
展望未來,后續(xù)的研究將集中于擴(kuò)大該方法的應(yīng)用范圍,以涵蓋更廣泛的微生物污染物,特別是那些代表當(dāng)前良好生產(chǎn)規(guī)范環(huán)境以及先前已確定的細(xì)胞治療產(chǎn)品污染物的微生物。此外,除了間充質(zhì)干細(xì)胞(MSCs)之外,還可以在更多的細(xì)胞類型上測試該模型的穩(wěn)健性。除了細(xì)胞治療產(chǎn)品的生產(chǎn)領(lǐng)域,這種方法還可以應(yīng)用于食品和飲料行業(yè),作為微生物質(zhì)量控制檢測的一部分,以確保食品產(chǎn)品符合安全標(biāo)準(zhǔn)。
參考資料
[1]Machine learning aided UV absorbance spectroscopy for microbial contamination in cell therapy products