核酸是分子生物學(xué)的基礎(chǔ),而核酸提取是整個(gè)分子行業(yè)繞不過(guò)去的門檻,很多時(shí)候核酸樣本提取的好壞直接決定了檢測(cè)結(jié)果是否生效。多種病毒性疾病檢測(cè)多數(shù)采用核酸檢測(cè)方法,質(zhì)優(yōu)的核酸提取是保證下游檢測(cè)結(jié)果的前提,西寶生物提供多種核心核酸提取試劑,品種齊全,現(xiàn)貨供應(yīng),省時(shí)方便,詳情致電400-021-8158。
核酸提取與純化的應(yīng)用
①分析基礎(chǔ)研究和疾病研究中的基因表達(dá);
②跟蹤對(duì)藥療的反應(yīng)(例如,在抗病毒診治期間和之后監(jiān)測(cè)病毒滴度);
③識(shí)別新物種并深入了解進(jìn)化過(guò)程(例如,Ancient DNA分析);
④對(duì)人類、動(dòng)物和植物中引起傳染病暴發(fā)的病原體進(jìn)行監(jiān)測(cè)和分類(例如:2019-nCoV檢測(cè));
⑤通過(guò)微生物檢測(cè)和量化監(jiān)測(cè)食品和水;
⑥診斷疾病(如基因疾病,癌癥,免疫學(xué)缺陷)。
核酸的分離是現(xiàn)代科學(xué)的重要成果之一,它給人類生活帶來(lái)了大的進(jìn)步。隨著高通量和自動(dòng)化提取技術(shù)的應(yīng)用,大大簡(jiǎn)化了DNA或RNA的分離過(guò)程。此外,下一代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展推動(dòng)了核酸分離純化市場(chǎng)的發(fā)展,因?yàn)镈NA和RNA的純化對(duì)獲得準(zhǔn)確的核酸數(shù)據(jù)起著極其重要的作用。
核酸提取與純化的原則和要求
1、保證核酸一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性
2、排除其它分子的污染(如提取DNA時(shí)排除RNA的干擾)
3、核酸樣品中不應(yīng)存在對(duì)酶有抑制作用的有機(jī)溶劑和高濃度的金屬離子
4、盡可能降低蛋白質(zhì)、多糖和脂類等大分子物質(zhì)
核酸提取純化方法眾多,但關(guān)鍵性試劑原料的質(zhì)量直接影響著核酸提取的純度和質(zhì)量,下面我們介紹一下常見的幾款核酸提取用試劑原料。
焦碳酸二乙酯(DEPC)
CAS:1609-47-8
焦碳酸二乙酯(DEPC):是一種強(qiáng)烈但不徹底的RNA酶抑制劑,他通過(guò)和RNA酶的活性基因團(tuán)組氨酸的咪唑環(huán)結(jié)合使蛋白質(zhì)變性,從而抑制酶的活性。可以用作抗菌添加劑、組氨酸殘基改性劑,以及用于亞胺轉(zhuǎn)變?yōu)榘被姿狨サ脑噭?/div>蛋白酶K
鹽酸胍 + 尿素
異硫氰酸胍
十二烷基硫酸鈉(SDS)
在溶液中濃度約為 0.1% (v/v) 時(shí)可使 RNase 失活,從而防止RNA被降解。
應(yīng)用
用作RNA酶抑制劑。用于提取RNA。
蛋白酶K
CAS:39450-01-6
蛋白酶K是一種枯草蛋白酶類的高活性蛋白酶,用于生物樣品中蛋白質(zhì)的一般降解。滅活核酸酶(DNase和RNase) , DNase和RNase也用于去除不需要的核酸,有人使用蛋白酶替代DEPC處理水,蛋白酶K是一種切割活性較廣的絲氨酸蛋白酶。它切割脂族氨基酸和芳香族氨基酸的羧基端肽鍵。在較廣的pH范圍內(nèi)均有活性(pH4-12.5)溫度范圍37-60度鹽濃度3mGuHCI或4m尿素中均有活性,在一些去污劑:Tween20 (5%)、Triton X-100 (1%)和SDS (1%)條件下也有活性。蛋白酶K的一般工作濃度是50-100ug/ml
蛋白酶K消化裂解法適用于所有標(biāo)本的消化處理,尤以DNA樣品為佳.如組織細(xì)胞(包括石蠟包埋組織)絨毛、毛發(fā)、精斑、血液(血清、血漿、全血)局部分泌物、尿,糞便等。
鹽酸胍 + 尿素
CAS:50-01-1 + CAS:57-13-6
鹽酸胍是一個(gè)核酸酶的強(qiáng)抑制劑,它并不是一種足夠強(qiáng)的變性劑,可以允許完整的RNA從富含Rase的組織中提取出來(lái)。核酸提取過(guò)程中用于使核酸結(jié)合在硅質(zhì)上,4-8M可斷裂氫鍵,有兩種可能機(jī)制:
1、變性蛋白和鹽酸胍、尿素優(yōu)先結(jié)合,形成變性蛋白-變性劑復(fù)合物,當(dāng)復(fù)合物被除去,從而引起N-D反應(yīng)平衡向右移動(dòng),隨著變性劑濃度增加,自然的蛋白不斷轉(zhuǎn)變?yōu)閺?fù)合物,導(dǎo)致蛋白質(zhì)變性;
2、鹽酸胍、尿素對(duì)氨基酸的增溶作用,能形成氫鍵,當(dāng)濃度高時(shí),能破壞水的氫鍵結(jié)構(gòu),結(jié)果鹽酸胍、尿素就稱為非極性殘基的較好溶劑,使蛋白質(zhì)內(nèi)部的疏水殘基伸展和溶解性加強(qiáng),鹽酸胍、尿素引起的變性往往是不可逆的。高濃度尿素使蛋白質(zhì)變性并抑制Rnase活性.
應(yīng)用
作為提取細(xì)胞總RNA實(shí)驗(yàn)中的強(qiáng)烈變性劑。鹽酸胍溶液可溶解蛋白質(zhì),導(dǎo)致細(xì)胞結(jié)構(gòu)破壞,核蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)破壞,從核酸上解離下來(lái),此外,RNA酶可被鹽酸胍等還原劑滅活。
異硫氰酸胍
CAS:593-84-0
異硫氰酸胍作為強(qiáng)力的蛋白質(zhì)變性劑,能迅速溶解蛋白質(zhì),導(dǎo)致細(xì)胞結(jié)構(gòu)破碎,核蛋白由于其二級(jí)結(jié)構(gòu)的破壞消失而迅速與核酸分離。胍鹽是破壞蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的離液劑,在通常使用的蛋白質(zhì)變性劑中作用強(qiáng)勁的是異硫氰酸胍,它們可以使多數(shù)蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)換成一隨機(jī)的卷曲狀態(tài)。在還原劑存在的情況下,異硫氰酸胍可以斷裂氫鍵。
總RNA抽提試劑常用的是TRIZol法,它可以直接從細(xì)胞或組織中提取總RNA。其含有苯酚、異硫氰酸胍等物質(zhì),能迅速破碎細(xì)胞并抑制細(xì)胞釋放出的核酸酶。
TRIZOL的主要成分是苯酚。苯酚的主要作用是裂解細(xì)胞,使細(xì)胞中的蛋白,核酸物質(zhì)解聚得到釋放。苯酚雖可變性蛋白質(zhì),但不能全部抑制RNA酶活性,因此TRIzol中還加入了8-羥基喹啉、異硫氰酸胍、β-巰基乙醇等來(lái)抑制內(nèi)源和外源RNase(RNA酶)。
※0.1%的8-羥基喹啉可以抑制RNase,與氯仿聯(lián)合使用可增強(qiáng)抑制作用。
※異硫氰酸胍屬于解偶劑,是一類蛋白質(zhì)變性劑,可溶解蛋白質(zhì)并使蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)消失,導(dǎo)致細(xì)胞結(jié)構(gòu)降解,核蛋白迅速與核酸分離。
※β-巰基乙醇的主要作用是破壞RNase蛋白質(zhì)中的二硫鍵。
十二烷基硫酸鈉(SDS)
CAS:151-21-3
十二烷基硫酸鈉(SDS)陰離子去垢劑,常用于進(jìn)行SDS-PAGE、DNA提取等需要蛋白變性的操作。高溫(55-65℃)裂解細(xì)胞,使染色體離析,蛋白變性,形成SDS/蛋白質(zhì)/多糖復(fù)合物,釋放核酸,提高鹽(KAC或NaAc)濃度并降低溫度(冰浴),使SDS/蛋白質(zhì)/復(fù)合物轉(zhuǎn)變?yōu)槿芙舛雀〉拟淃}酸形式,使蛋白質(zhì)及多糖雜質(zhì)沉淀更加好、離心后除去沉淀,上清液中的DNA用酚/氯仿抽提,乙醇沉淀水相中的DNA
操作簡(jiǎn)單,溫和,可提取到高分子量的DNA,但產(chǎn)物多糖類雜質(zhì)較多
SDS能裂解細(xì)胞。使細(xì)胞中的蛋白質(zhì)和核酸之間常借著靜電引力或配位鍵結(jié)合,陰離子去污劑能夠破壞這種價(jià)鍵,使染色體離析,蛋白變性,釋放核酸。
(1) SDS是一種陰離子表面活性劑,能使蛋白質(zhì)的氫鍵和疏水鍵打開,并結(jié)合到蛋白質(zhì)的疏水部位;
(2) SDS可引起蛋白質(zhì)構(gòu)象改變
(3) SDS是一種良好的解離劑,可使蛋白質(zhì)溶解,變性
(4) 形成SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物,并使復(fù)合物帶負(fù)電
(2) SDS可引起蛋白質(zhì)構(gòu)象改變
(3) SDS是一種良好的解離劑,可使蛋白質(zhì)溶解,變性
(4) 形成SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物,并使復(fù)合物帶負(fù)電
西寶生物核酸提取相關(guān)產(chǎn)品列表
產(chǎn)品名稱 | 貨號(hào) | 包裝 |
DEPC Diethyl pyrocarbonate 焦碳酸二乙酯(液體) 1609-47-8 | BCE1180A | 25ml |
Guanidine Thiocyanate 異硫氰酸胍 593-84-0 | ACH0012B | 250g |
Guanidine hydrochloride 鹽酸胍 50-01-1 | ACH0011A | 1kg |
Proteinase K 蛋白酶K 39450-01-6 | EBY0027M | 100mg、1kg |
Sodium dodecyl sulfate 十二烷基硫酸鈉(SDS) 151-21-3 | ACH0017A | 25kg |
Urea 尿素 57-13-6 | ACH0029E | 500g |
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西寶生物診斷疫苗團(tuán)隊(duì)為您服務(wù): 400-021-8158
核酸是分子生物學(xué)的基礎(chǔ),而核酸提取是整個(gè)分子行業(yè)繞不過(guò)去的門檻,很多時(shí)候核酸樣本提取的好壞直接決定了檢測(cè)結(jié)果是否生效。多種病毒性疾病檢測(cè)多數(shù)采用核酸檢測(cè)方法,質(zhì)優(yōu)的核酸提取是保證下游檢測(cè)結(jié)果的前提,西寶生物提供多種核心核酸提取試劑,品種齊全,現(xiàn)貨供應(yīng),省時(shí)方便,詳情致電400-021-8158。
核酸提取與純化的應(yīng)用
①分析基礎(chǔ)研究和疾病研究中的基因表達(dá);
②跟蹤對(duì)藥療的反應(yīng)(例如,在抗病毒診治期間和之后監(jiān)測(cè)病毒滴度);
③識(shí)別新物種并深入了解進(jìn)化過(guò)程(例如,Ancient DNA分析);
④對(duì)人類、動(dòng)物和植物中引起傳染病暴發(fā)的病原體進(jìn)行監(jiān)測(cè)和分類(例如:2019-nCoV檢測(cè));
⑤通過(guò)微生物檢測(cè)和量化監(jiān)測(cè)食品和水;
⑥診斷疾病(如基因疾病,癌癥,免疫學(xué)缺陷)。
核酸的分離是現(xiàn)代科學(xué)的重要成果之一,它給人類生活帶來(lái)了大的進(jìn)步。隨著高通量和自動(dòng)化提取技術(shù)的應(yīng)用,大大簡(jiǎn)化了DNA或RNA的分離過(guò)程。此外,下一代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展推動(dòng)了核酸分離純化市場(chǎng)的發(fā)展,因?yàn)镈NA和RNA的純化對(duì)獲得準(zhǔn)確的核酸數(shù)據(jù)起著極其重要的作用。
核酸提取與純化的原則和要求
1、保證核酸一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性
2、排除其它分子的污染(如提取DNA時(shí)排除RNA的干擾)
3、核酸樣品中不應(yīng)存在對(duì)酶有抑制作用的有機(jī)溶劑和高濃度的金屬離子
4、盡可能降低蛋白質(zhì)、多糖和脂類等大分子物質(zhì)
核酸提取純化方法眾多,但關(guān)鍵性試劑原料的質(zhì)量直接影響著核酸提取的純度和質(zhì)量,下面我們介紹一下常見的幾款核酸提取用試劑原料。
焦碳酸二乙酯(DEPC)
CAS:1609-47-8
焦碳酸二乙酯(DEPC):是一種強(qiáng)烈但不徹底的RNA酶抑制劑,他通過(guò)和RNA酶的活性基因團(tuán)組氨酸的咪唑環(huán)結(jié)合使蛋白質(zhì)變性,從而抑制酶的活性??梢杂米骺咕砑觿⒔M氨酸殘基改性劑,以及用于亞胺轉(zhuǎn)變?yōu)榘被姿狨サ脑噭?/div>蛋白酶K
鹽酸胍 + 尿素
異硫氰酸胍
十二烷基硫酸鈉(SDS)
在溶液中濃度約為 0.1% (v/v) 時(shí)可使 RNase 失活,從而防止RNA被降解。
應(yīng)用
用作RNA酶抑制劑。用于提取RNA。
蛋白酶K
CAS:39450-01-6
蛋白酶K是一種枯草蛋白酶類的高活性蛋白酶,用于生物樣品中蛋白質(zhì)的一般降解。滅活核酸酶(DNase和RNase) , DNase和RNase也用于去除不需要的核酸,有人使用蛋白酶替代DEPC處理水,蛋白酶K是一種切割活性較廣的絲氨酸蛋白酶。它切割脂族氨基酸和芳香族氨基酸的羧基端肽鍵。在較廣的pH范圍內(nèi)均有活性(pH4-12.5)溫度范圍37-60度鹽濃度3mGuHCI或4m尿素中均有活性,在一些去污劑:Tween20 (5%)、Triton X-100 (1%)和SDS (1%)條件下也有活性。蛋白酶K的一般工作濃度是50-100ug/ml
蛋白酶K消化裂解法適用于所有標(biāo)本的消化處理,尤以DNA樣品為佳.如組織細(xì)胞(包括石蠟包埋組織)絨毛、毛發(fā)、精斑、血液(血清、血漿、全血)局部分泌物、尿,糞便等。
鹽酸胍 + 尿素
CAS:50-01-1 + CAS:57-13-6
鹽酸胍是一個(gè)核酸酶的強(qiáng)抑制劑,它并不是一種足夠強(qiáng)的變性劑,可以允許完整的RNA從富含Rase的組織中提取出來(lái)。核酸提取過(guò)程中用于使核酸結(jié)合在硅質(zhì)上,4-8M可斷裂氫鍵,有兩種可能機(jī)制:
1、變性蛋白和鹽酸胍、尿素優(yōu)先結(jié)合,形成變性蛋白-變性劑復(fù)合物,當(dāng)復(fù)合物被除去,從而引起N-D反應(yīng)平衡向右移動(dòng),隨著變性劑濃度增加,自然的蛋白不斷轉(zhuǎn)變?yōu)閺?fù)合物,導(dǎo)致蛋白質(zhì)變性;
2、鹽酸胍、尿素對(duì)氨基酸的增溶作用,能形成氫鍵,當(dāng)濃度高時(shí),能破壞水的氫鍵結(jié)構(gòu),結(jié)果鹽酸胍、尿素就稱為非極性殘基的較好溶劑,使蛋白質(zhì)內(nèi)部的疏水殘基伸展和溶解性加強(qiáng),鹽酸胍、尿素引起的變性往往是不可逆的。高濃度尿素使蛋白質(zhì)變性并抑制Rnase活性.
應(yīng)用
作為提取細(xì)胞總RNA實(shí)驗(yàn)中的強(qiáng)烈變性劑。鹽酸胍溶液可溶解蛋白質(zhì),導(dǎo)致細(xì)胞結(jié)構(gòu)破壞,核蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)破壞,從核酸上解離下來(lái),此外,RNA酶可被鹽酸胍等還原劑滅活。
異硫氰酸胍
CAS:593-84-0
異硫氰酸胍作為強(qiáng)力的蛋白質(zhì)變性劑,能迅速溶解蛋白質(zhì),導(dǎo)致細(xì)胞結(jié)構(gòu)破碎,核蛋白由于其二級(jí)結(jié)構(gòu)的破壞消失而迅速與核酸分離。胍鹽是破壞蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的離液劑,在通常使用的蛋白質(zhì)變性劑中作用強(qiáng)勁的是異硫氰酸胍,它們可以使多數(shù)蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)換成一隨機(jī)的卷曲狀態(tài)。在還原劑存在的情況下,異硫氰酸胍可以斷裂氫鍵。
總RNA抽提試劑常用的是TRIZol法,它可以直接從細(xì)胞或組織中提取總RNA。其含有苯酚、異硫氰酸胍等物質(zhì),能迅速破碎細(xì)胞并抑制細(xì)胞釋放出的核酸酶。
TRIZOL的主要成分是苯酚。苯酚的主要作用是裂解細(xì)胞,使細(xì)胞中的蛋白,核酸物質(zhì)解聚得到釋放。苯酚雖可變性蛋白質(zhì),但不能全部抑制RNA酶活性,因此TRIzol中還加入了8-羥基喹啉、異硫氰酸胍、β-巰基乙醇等來(lái)抑制內(nèi)源和外源RNase(RNA酶)。
※0.1%的8-羥基喹啉可以抑制RNase,與氯仿聯(lián)合使用可增強(qiáng)抑制作用。
※異硫氰酸胍屬于解偶劑,是一類蛋白質(zhì)變性劑,可溶解蛋白質(zhì)并使蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)消失,導(dǎo)致細(xì)胞結(jié)構(gòu)降解,核蛋白迅速與核酸分離。
※β-巰基乙醇的主要作用是破壞RNase蛋白質(zhì)中的二硫鍵。
十二烷基硫酸鈉(SDS)
CAS:151-21-3
十二烷基硫酸鈉(SDS)陰離子去垢劑,常用于進(jìn)行SDS-PAGE、DNA提取等需要蛋白變性的操作。高溫(55-65℃)裂解細(xì)胞,使染色體離析,蛋白變性,形成SDS/蛋白質(zhì)/多糖復(fù)合物,釋放核酸,提高鹽(KAC或NaAc)濃度并降低溫度(冰浴),使SDS/蛋白質(zhì)/復(fù)合物轉(zhuǎn)變?yōu)槿芙舛雀〉拟淃}酸形式,使蛋白質(zhì)及多糖雜質(zhì)沉淀更加好、離心后除去沉淀,上清液中的DNA用酚/氯仿抽提,乙醇沉淀水相中的DNA
操作簡(jiǎn)單,溫和,可提取到高分子量的DNA,但產(chǎn)物多糖類雜質(zhì)較多
SDS能裂解細(xì)胞。使細(xì)胞中的蛋白質(zhì)和核酸之間常借著靜電引力或配位鍵結(jié)合,陰離子去污劑能夠破壞這種價(jià)鍵,使染色體離析,蛋白變性,釋放核酸。
(1) SDS是一種陰離子表面活性劑,能使蛋白質(zhì)的氫鍵和疏水鍵打開,并結(jié)合到蛋白質(zhì)的疏水部位;
(2) SDS可引起蛋白質(zhì)構(gòu)象改變
(3) SDS是一種良好的解離劑,可使蛋白質(zhì)溶解,變性
(4) 形成SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物,并使復(fù)合物帶負(fù)電
(2) SDS可引起蛋白質(zhì)構(gòu)象改變
(3) SDS是一種良好的解離劑,可使蛋白質(zhì)溶解,變性
(4) 形成SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物,并使復(fù)合物帶負(fù)電
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產(chǎn)品名稱 | 貨號(hào) | CAS | 包裝 |
DEPC Diethyl pyrocarbonate 焦碳酸二乙酯(液體) | BCE1180A | 1609-47-8 | 25ml |
Guanidine Thiocyanate 異硫氰酸胍 | ACH0012B | 593-84-0 | 250g |
Guanidine hydrochloride 鹽酸胍 | ACH0011A | 50-01-1 | 1kg |
Proteinase K 蛋白酶K | EBY0027M | 39450-01-6 | 100mg、1kg |
Sodium dodecyl sulfate 十二烷基硫酸鈉(SDS) | ACH0017A | 151-21-3 | 25kg |
Urea 尿素 | ACH0029E | 57-13-6 | 500g |
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