摘要：截至7月2日，各國研究人員在全球流感及新型冠狀病毒數(shù)據(jù)平臺(tái)“GISAID”（Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data）等國際新冠病毒基因組數(shù)據(jù)庫中共提交了85個(gè)BA.2.75變種的基因序列。這種編號(hào)為“BA.2.75”的奧密克戎毒株新型變種引發(fā)各國科學(xué)家的高度關(guān)注。
7月3日，根據(jù)以色列病毒學(xué)實(shí)驗(yàn)室研究員Shay Fleishon獲取的序列信息，印度有10個(gè)邦或已出現(xiàn)奧密克戎變異毒株BA.2.75，該變種一開始發(fā)現(xiàn)于來自印度的基因序列，之后迅速在英國、美國、日本、加拿大、澳大利亞、新西蘭、德國等其他7個(gè)國家相繼出現(xiàn)。
圖1 Shay Fleishon公開平臺(tái)發(fā)文（圖源：twitter）
■ BA.2.75或成首個(gè)成功突變的“第二代變種”
根據(jù)Shay Fleishon等人的解釋，第二代變種是指由第一代變種進(jìn)化而來，但具有突變較多、差異較大等特點(diǎn)的變種。對(duì)奧密克戎毒株來說，BA.1、BA.2、BA.3、BA.4、BA.5等變種屬于“第一代變種”，而BA.2.75則可能成為首個(gè)“第二代變種”。關(guān)于新冠病毒進(jìn)化枝的發(fā)育圖可參考圖2。
圖2 新冠病毒進(jìn)化枝的系統(tǒng)發(fā)育圖（圖源：[2]）
Shay Fleishon表示，在BA.2.75之前，研究人員已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了很多的新冠病毒的“第二代變種”，但發(fā)現(xiàn)這些二代變種都沒能大范圍傳播，導(dǎo)致樣本量很少。但是，此次突變的BA.2.75已在多個(gè)不同國家傳播開來，或能成為首個(gè)成功突變的“第二代變種”。BA.2.75代表著奧密克戎毒株的進(jìn)一步進(jìn)化，未來可能會(huì)出現(xiàn)更復(fù)雜的基因突變。
■ 傳播速度快！BA.2.75未來或掀起新疫情
此前的研究表明，奧密克戎毒株BA.2變種的傳染性強(qiáng)于更早出現(xiàn)的BA.1變種。去年年底，奧密克戎毒株BA.1變種在全球掀起一輪空前的疫情高峰；今年3-4月間，BA.2逐步“取代”BA.1導(dǎo)致美國、歐洲等國進(jìn)入另一輪疫情；進(jìn)入6月后，BA.4、BA.5變種的擴(kuò)散使歐洲、以色列等地疫情再度加劇。
作為“第二代變種”，BA.2.75擁有眾多“不尋?！钡耐蛔?，其傳染速度較快，或可突破現(xiàn)有疫苗和毒株感染構(gòu)建的免疫屏障。有專家表示，該變種可替代BA.2、BA.4等現(xiàn)有變種，在全球掀起新的疫情高峰。倫敦帝國理工學(xué)院病毒學(xué)家Tom Peacock稱，第二代變種BA.2.75從已經(jīng)存在的、成功的變種中突變而來，這種新變種毒株有多重尖峰突變，傳播性強(qiáng)，更具威脅性，需要對(duì)其保持“密切關(guān)注”。
30年來，全世界已經(jīng)花費(fèi)了170多億美元，努力通過接種疫苗運(yùn)動(dòng)根除該病毒。2020年底，世衛(wèi)組織緊急批準(zhǔn)了一種名為nOPV2的改良疫苗，以阻止非洲和東地中海國家流行的疫苗衍生脊髓灰質(zhì)炎病毒的暴發(fā)。疫苗中的病毒經(jīng)過了基因改造，以防止其變得有害。
根據(jù)全球根除脊髓灰質(zhì)炎全球行動(dòng)計(jì)劃，自2021年3月以來，已有15個(gè)國家接種了3億多劑nOPV2疫苗。在華盛頓西雅圖的比爾和梅琳達(dá)·蓋茨基金會(huì)進(jìn)行脊髓灰質(zhì)炎研究的公共衛(wèi)生流行病學(xué)家Ananda Bandyopadhyay說，這種疫苗“是一種令我們都非常興奮的工具”。
圖3 Tom Peacock公開平臺(tái)發(fā)文（圖源：twitter）
澳大利亞數(shù)據(jù)處理專家Michael?Horney認(rèn)為，BA.2.75傳播速度極快，6月15日至30日間，該變種占印度上傳的基因組樣本的比例由不到5%迅速上升到18%，正在快速取代其他變種，其傳播速度比BA.2、BA.5變種似乎都要快。
圖4 奧密克戎變異毒株BA.2.75發(fā)現(xiàn)于來自印度的基因序列
專家表示，除了奧密克戎變體中已經(jīng)存在的突變之外，BA.2.75變體還包括刺突蛋白中的新突變。在這些突變中，G446S和R493Q尤其值得關(guān)注，因?yàn)樗x予了變體逃避幾種抗體的能力。這意味著它可以感染已接種疫苗或以前曾被感染的人。截至目前，BA.2.75的抗體逃逸似乎與當(dāng)前疫苗的BA.4/5相似。研究表明，R493Q突變增加了病毒附著在ACE2上的能力（注：ACE2是可以幫助新冠病毒進(jìn)入細(xì)胞的蛋白質(zhì)）[1]。
目前已獲取85個(gè)BA.2.75的基因序列，主要來自印度10個(gè)邦和其它7個(gè)國家。日本、德國、英國、加拿大、美國、澳大利亞和新西蘭已出現(xiàn)BA.2.75毒株病例。由于各國共享的新冠病毒基因組數(shù)量僅為全球新冠病例數(shù)的“冰山一角”，因此感染BA.2.75變種的實(shí)際人數(shù)要遠(yuǎn)大于實(shí)際播報(bào)人數(shù)。
Fleishon表示，現(xiàn)階段預(yù)測BA.2.75毒株是否會(huì)成為下一個(gè)主流變種病毒還為時(shí)過早，但BA.2.75的出現(xiàn)“令人震驚”，因?yàn)樗赡馨凳局乱徊ㄐ鹿谝咔榧磳⒌絹怼?/div>
參考資料：
[1]https://www.dnaindia.com/health/report-what-we-know-so-far-about-omicron-ba-2-75-sub-variant-spreading-18-percent-more-covid-19-delta-2966072
[2]https://master.clades.nextstrain.org/
[2]https://master.clades.nextstrain.org/
摘要：截至7月2日，各國研究人員在全球流感及新型冠狀病毒數(shù)據(jù)平臺(tái)“GISAID”（Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data）等國際新冠病毒基因組數(shù)據(jù)庫中共提交了85個(gè)BA.2.75變種的基因序列。這種編號(hào)為“BA.2.75”的奧密克戎毒株新型變種引發(fā)各國科學(xué)家的高度關(guān)注。
7月3日，根據(jù)以色列病毒學(xué)實(shí)驗(yàn)室研究員Shay Fleishon獲取的序列信息，印度有10個(gè)邦或已出現(xiàn)奧密克戎變異毒株BA.2.75，該變種一開始發(fā)現(xiàn)于來自印度的基因序列，之后迅速在英國、美國、日本、加拿大、澳大利亞、新西蘭、德國等其他7個(gè)國家相繼出現(xiàn)。
圖1 Shay Fleishon公開平臺(tái)發(fā)文（圖源：twitter）
■ BA.2.75或成首個(gè)成功突變的“第二代變種”
根據(jù)Shay Fleishon等人的解釋，第二代變種是指由第一代變種進(jìn)化而來，但具有突變較多、差異較大等特點(diǎn)的變種。對(duì)奧密克戎毒株來說，BA.1、BA.2、BA.3、BA.4、BA.5等變種屬于“第一代變種”，而BA.2.75則可能成為首個(gè)“第二代變種”。關(guān)于新冠病毒進(jìn)化枝的發(fā)育圖可參考圖2。
圖2 新冠病毒進(jìn)化枝的系統(tǒng)發(fā)育圖（圖源：[2]）
Shay Fleishon表示，在BA.2.75之前，研究人員已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了很多的新冠病毒的“第二代變種”，但發(fā)現(xiàn)這些二代變種都沒能大范圍傳播，導(dǎo)致樣本量很少。但是，此次突變的BA.2.75已在多個(gè)不同國家傳播開來，或能成為首個(gè)成功突變的“第二代變種”。BA.2.75代表著奧密克戎毒株的進(jìn)一步進(jìn)化，未來可能會(huì)出現(xiàn)更復(fù)雜的基因突變。
■ 傳播速度快！BA.2.75未來或掀起新疫情
此前的研究表明，奧密克戎毒株BA.2變種的傳染性強(qiáng)于更早出現(xiàn)的BA.1變種。去年年底，奧密克戎毒株BA.1變種在全球掀起一輪空前的疫情高峰；今年3-4月間，BA.2逐步“取代”BA.1導(dǎo)致美國、歐洲等國進(jìn)入另一輪疫情；進(jìn)入6月后，BA.4、BA.5變種的擴(kuò)散使歐洲、以色列等地疫情再度加劇。
作為“第二代變種”，BA.2.75擁有眾多“不尋?！钡耐蛔?，其傳染速度較快，或可突破現(xiàn)有疫苗和毒株感染構(gòu)建的免疫屏障。有專家表示，該變種可替代BA.2、BA.4等現(xiàn)有變種，在全球掀起新的疫情高峰。倫敦帝國理工學(xué)院病毒學(xué)家Tom Peacock稱，第二代變種BA.2.75從已經(jīng)存在的、成功的變種中突變而來，這種新變種毒株有多重尖峰突變，傳播性強(qiáng)，更具威脅性，需要對(duì)其保持“密切關(guān)注”。
30年來，全世界已經(jīng)花費(fèi)了170多億美元，努力通過接種疫苗運(yùn)動(dòng)根除該病毒。2020年底，世衛(wèi)組織緊急批準(zhǔn)了一種名為nOPV2的改良疫苗，以阻止非洲和東地中海國家流行的疫苗衍生脊髓灰質(zhì)炎病毒的暴發(fā)。疫苗中的病毒經(jīng)過了基因改造，以防止其變得有害。
根據(jù)全球根除脊髓灰質(zhì)炎全球行動(dòng)計(jì)劃，自2021年3月以來，已有15個(gè)國家接種了3億多劑nOPV2疫苗。在華盛頓西雅圖的比爾和梅琳達(dá)·蓋茨基金會(huì)進(jìn)行脊髓灰質(zhì)炎研究的公共衛(wèi)生流行病學(xué)家Ananda Bandyopadhyay說，這種疫苗“是一種令我們都非常興奮的工具”。
圖3 Tom Peacock公開平臺(tái)發(fā)文（圖源：twitter）
澳大利亞數(shù)據(jù)處理專家Michael?Horney認(rèn)為，BA.2.75傳播速度極快，6月15日至30日間，該變種占印度上傳的基因組樣本的比例由不到5%迅速上升到18%，正在快速取代其他變種，其傳播速度比BA.2、BA.5變種似乎都要快。
圖4 奧密克戎變異毒株BA.2.75發(fā)現(xiàn)于來自印度的基因序列
專家表示，除了奧密克戎變體中已經(jīng)存在的突變之外，BA.2.75變體還包括刺突蛋白中的新突變。在這些突變中，G446S和R493Q尤其值得關(guān)注，因?yàn)樗x予了變體逃避幾種抗體的能力。這意味著它可以感染已接種疫苗或以前曾被感染的人。截至目前，BA.2.75的抗體逃逸似乎與當(dāng)前疫苗的BA.4/5相似。研究表明，R493Q突變增加了病毒附著在ACE2上的能力（注：ACE2是可以幫助新冠病毒進(jìn)入細(xì)胞的蛋白質(zhì)）[1]。
目前已獲取85個(gè)BA.2.75的基因序列，主要來自印度10個(gè)邦和其它7個(gè)國家。日本、德國、英國、加拿大、美國、澳大利亞和新西蘭已出現(xiàn)BA.2.75毒株病例。由于各國共享的新冠病毒基因組數(shù)量僅為全球新冠病例數(shù)的“冰山一角”，因此感染BA.2.75變種的實(shí)際人數(shù)要遠(yuǎn)大于實(shí)際播報(bào)人數(shù)。
Fleishon表示，現(xiàn)階段預(yù)測BA.2.75毒株是否會(huì)成為下一個(gè)主流變種病毒還為時(shí)過早，但BA.2.75的出現(xiàn)“令人震驚”，因?yàn)樗赡馨凳局乱徊ㄐ鹿谝咔榧磳⒌絹怼?/div>
參考資料：
[1]https://www.dnaindia.com/health/report-what-we-know-so-far-about-omicron-ba-2-75-sub-variant-spreading-18-percent-more-covid-19-delta-2966072
[2]https://master.clades.nextstrain.org/
[2]https://master.clades.nextstrain.org/
